Je viens de le dire, le launcher est en 32 bits et est conçu pour aller dans C:\Program Files (x86)
.
Par contre si tu regardes bien, le Java embarqué qu'il télécharge, en bien en 64 bits : C:\Program Files (x86)\Minecraft\runtime\jre-x64
(Minecraft embarque Java depuis quelque année, il n'est en réalité plus nécessaire de l'installer, sauf si on veut lancer le serveur ou un installateur de mod).