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http://minecraft.gamepedia.com/Server.properties a dit:
Sets permission level for ops. 1 - Ops can bypass spawn protection. 2 - Ops can use /clear, /difficulty, /effect, /gamemode, /gamerule, /give, and /tp, and can edit command blocks. 3 - Ops can use /ban, /deop, /kick, and /op. 4 - Ops can use /stop.
Donc il suffit d'éditer la valeur de op-permission-level et de mettre 3 dans le fichier server.properties =)
Et de redémarrer évidemment pour que la valeur soit prise en compte.
Si c'est un simple serveur vanilla, aucune raison pour que ça ne fonctionne pas.
Je pense que c'est parce que tu es déjà défini en op level 4, faut donc que tu édites également le fichier ops.json de ton serveur pour remplacer tous les levels 4 des opérateurs par des levels 3, et ensuite redémarrer ton serveur pour que ça soit effectif.