Fatally missing blocks and items peut venir de différentes choses.
Tout d'abord télécharges sur ton client toutes les config du dossier config du serveur, ça peut être dû au fait que certains blocks ou items sont désactivés sur ton client.
Vérifies qu'il ne te manque aucun mod côté client, et éventuellement regarde ce que te dit la console du serveur quand tu te connectes. Regarde notamment si tu as une ligne "Attempting connection with missing mods [mod1,mod2..] at CLIENT" qui s'affiche sur la console du serveur et quels sont ces missing mods. Attention c'est souvent normal d'avoir une longue liste de ce type dans ta console client mais ce qu'il faut regarder ici est ta console Serveur !
Quant à ton dernier Pastebin il n'est pas vraiment très parlant à mes yeux... Tout ce que je peux te dire c'est que ce n'est pas à proprement parler un crash mais plutôt un arrêt normal du serveur dû à une erreur anormale.
Au fait, qu'est-ce que tu utilises pour ce serveur, Forge, Cauldron, KCauldron, autre chose ?